對於今日旺報(含中時電子報轉刊)指稱教育部於兩岸教育交流淪為政治打手之報導，教育部回應如下：
- 教育部對於該報導未詳予查證即逕行報導，深表遺憾並嚴正聲明教育部並無報導所稱對各大學電話關切之情事。
- 該篇報導忽視中國大陸對兩岸教育交流向來採取「由上而下」及「中央管制」模式，報導所稱「陸生來臺人數減少」的情形，實係導源於中國大陸不顧大陸學生的需求及兩岸之間友善學術交流的默契，由上而下直接限縮陸生來臺就學與交流，該報漠視中國大陸對於各項來臺教育交政策與活動均呈現單邊嚴重傾斜的情形，更忽略我國向是一個民主自由、多元開放及資訊流通的社會，政府對於兩岸間師生各項教育交流活動向來予以尊重之事實，教育部再次表示遺憾。
- 教育部向來支持兩岸間良性及雙向的教育交流與互動，兩岸學校間、以及青年學生進行正常有序的交流，對促進雙方的瞭解與認識，以及實際發揮雙方交流均有助益，因此教育部將持續推動兩岸間對等、互惠及正常的學術與教育交流。
- 教育部提醒兩岸學校及青年學生應以「對等互惠」原則進行「正常有序」的交流，各項教育交流活動均不得違反「臺灣地區與大陸地區人民關係條例」及國內相關法規。
- 教育部提醒學生及家長赴陸交流時，針對兩岸的文化、政治不同，而且各項措施高度人制的政治現實，應評估可能的風險。有關國人赴陸交流或就學，除基於個人生涯規劃外，亦應深入考量兩岸在制度、法令規定上有所不同，面對彼此社會發展與文化差異，做好調適準備，以保障及維護自身權益。